一般大棚连续多年栽培苦瓜，不但可导致土传病菌的大量繁殖和积累，还可致使大量营养元素和部分微量元素含量的下降或比例失调，从而导致苦瓜土传病害的蔓延和生理障碍的发生，造成苦瓜品质下降，产量降低甚至绝收。
苦瓜嫁接苗就是利用具有抗土传病害且不影响苦瓜品质的砧木品种（如黑籽南瓜、丝瓜等）和生产上栽培的苦瓜品种进行嫁接，以达到抗病增产目的的育苗技术。因此，苦瓜嫁接育苗技术是解决保护地苦瓜栽培土传病害和生理性病害的有效措施之一。
苦瓜嫁接苗的优点
1、增强植株抗病能力：利用抗病砧木嫁接的苦瓜，可以有效地抵御土传病菌的侵害，是预防苦瓜枯萎病、蔓枯病和疫霉病的最有效措施。
2、提高植株耐低温能力：由于砧木根系发达，抗逆性强，嫁接苗具有明显的耐低温性能。
3、克服连作障碍：苦瓜忌连作，日光温室栽培极易受到土壤积盐和有害物质的伤害，换用黑籽南瓜根以后，可以大大减轻土壤积盐和有害物质的危害。
4、扩大了根系吸收范围和吸收性能：嫁接苗植株根系比自根苗成倍增长，在相同的土壤面积上比自根苗多吸收30%的氮、钾和80%的磷素，且能利用深层土壤中的磷素。
5、有利于提高产量：嫁接苗茎粗叶大，光合面积大，可使产量增加四成以上。