施肥方法常用沼肥有两种，一是作基肥的沼渣，二是作追肥和叶面肥的沼液。
基肥施基肥应在无果期进行，一般在每年的4月初或11月底(沼气池出料或大换料期间)施沼渣作基肥，根据树的大小，每棵枣树施沼渣15~30公斤，具体方法是在枣树四周挖4~6个坑，深度为30-40厘米，施肥，灌水，待水分渗干后及时覆土填平，以保肥效和防止冻伤树根。
追肥沼液作追肥的施用时间在5月份催芽期，6~8月份开花挂果期和9月份壮果期，每年施3~5次，每次每株施用沼液40公斤左右，具体方法是：沿根挖成条形沟或在树的四周挖4~6个坑，也可挖成圆弧形沟，深30厘米、宽20厘米，待沼液渗干后及时覆土。这期间施肥有利于花芽分化，增加有效花的数量，补充较多养分，提高坐果率，促进果实生长。
注意事项沼渣、沼液作基肥和追肥施用时，应与树根保持一定距离，防止挖断和烧伤树根;叶面喷施的时间不宜在中午高温时段喷施;若出现病虫害，可将农药掺入沼液中喷施。