深翻土壤，增施充分发酵腐熟的有机肥。对土壤进行深翻是消除土壤板结、增加活土层的重要措施。在深翻的同时，大量施入充分发酵腐熟的有机肥，不仅可以改良土壤结构，提高土壤理化性能，而且能供给黄瓜根系发育所需的营养。
采用科学配方施肥。不同的肥料对黄瓜根系的发生与发展作用是不一样的。比如钙直接影响根尖分生组织的生长，锌决定根尖的生长速度，磷能促进根系细胞的分裂和伸展。所以，应配方均衡施肥。
保护好根系。适时播种、适期嫁接、护根定植、适时覆盖和揭除地膜和中耕松土等，都是保护根系的重要措施。当发生根部病害时，要选用根施通与护树将军配合灌根，能诱导病毒集结，供护树将军靶向消毒，抑制果树根部病毒传导式感染及叶片和果实，保养植株输导系统健康工作。