在番茄的整个生长期，应根据其生长特点采取适量的配方施肥，可确保番茄优质高产。其施肥方法是：
定植期施足底肥秧苗移栽前每亩施足量优质农家肥；尿素10公斤、磷酸铵10公斤、过磷酸钙40－50公斤，或者亩施足量优质土杂肥、硫酸钾三元复合肥25－50公斤、尿素10公斤。
壮秧期施肥番茄幼苗长至5－6片叶时，如叶色变淡可进行叶面喷肥。常用的肥料有300倍尿素溶液、300倍磷酸二氢钾溶液、0.1%－0.3%硫酸钾复合肥溶液。在壮秧期每隔10天左右喷施1次。另外，叶面喷肥可与防治病虫结合进行。
结果期适时追肥第一果的直径长至1.5－2.5厘米时追肥浇水，一般每亩用硝酸铵15－20公斤、过磷酸钙20－30公斤，或者用尿素5公斤、硫酸钾复合肥10－20公斤，地面撒施后水冲施入。第二和第三果长到直径3厘米大小时，分别进行第二和第三次施肥浇水，每亩用尿素水10公斤、硫酸钾复合肥15－20公斤，方法同第一次。在盛果期，可结合喷药进行根外追肥，可用磷酸二氢钾、禾液肥、过磷酸钙等肥料，有利于果实着色及品质的提高。