棉花苗期重要病害有立枯病、炭疽病、红腐病、猝倒病、黑斑病、茎枯病等，应接纳综合办法防治。
改进泥土经由过程增施无机肥、推行秸秆还田、精耕细作等办法培肥地力，改进泥土，能有用掌握苗期病害。理论讲明，棉花秸秆还田能进步棉田无机质和钾元素含量，克制和加重苗期病害产生。
选用劣种选用抗病种类，同时用25克／升咯菌腈悬浮种衣剂包衣，能预防苗期病害。
适期晚播地温稳固在14℃以上时收获，本年天气失常，气温偏低，应比终年推延5—10天收获。适期晚播能下降苗期病害产生，还能预防早衰和烂铃。
公道化除播前每亩用48％氟乐灵乳油60—72毫升(地膜笼罩棉田每亩用50毫升)，施药后混土。比年应用氟乐灵的棉田应替换其他除草剂，避免药害产生，减轻苗期病害。应用90%乙草胺乳油，每亩用量掌握在50—60毫升，在播后苗前施用，地膜笼罩棉田不宜施用。播前或播后苗前每亩用33％二甲戊灵乳油66—100毫升，该药对阔叶草防效差，阔叶草多的田宜将其与其他药混用。72%异丙甲草胺乳油每亩用量为100毫升，播后苗前施用，泥土干旱时需浅混土。
增强田管出苗前后增强以中耕松土为重点的田间治理，增温保墒，加重苗病伤害，雨后留意划锄。地膜笼罩棉实时放苗压土堵毛病，避免年夜风掀膜。病害严重地块早间苗(1叶l心期)晚定苗(3叶期后)，确保苗全、苗壮。
药剂防治棉花苗期病害有2个产生岑岭期，即棉苗l叶期和3叶期，应实时预防，平日每亩用85％三氯异氰尿酸可湿性粉剂35克加水喷雾。病害产生早期可用50%多菌灵可湿性粉剂、70%代森锰锌水份散粒剂、70%甲基硫菌灵可湿性粉剂500—800倍液喷雾。晚期产生繁茂病可用新克黄枯等黄腐酸盐类叶面肥喷雾，加强植株抗病才能。用10亿个活芽孢／克枯草芽孢杆菌可湿性粉剂500倍液灌根，对苗期病害有较好的防效。