作储藏用的莲藕，应为无病伤、质地坚实、藕肉肥厚、含水量少的地下茎，采收后不洗涤，表面带泥整支储藏。
储藏方法：先用砖砌或用板条箱、木板等封围成埋藏坑，然后一层莲藕一层泥土，堆5-6层后，再覆盖10厘米左右细泥，细泥应细软带潮，手捏不成团，并去碎石等杂物。埋藏时，莲藕要按顺序一排排放齐，避免折断。
用水泥地板的房间埋藏，坑底需先用木板或竹架垫起10厘米，形成一个隔底，在隔底上铺一层10厘米厚的细泥土，再按上法堆码覆土。储藏室每隔15天消毒一次。
利用室外露地埋藏时，应选择地势高而且背阳避光的地方，将泥、藕相间层层堆成斜坡式或宝塔形，用泥全部覆盖，周围挖好排水沟防积水，遇雨天应及时遮盖。
储藏中应每隔20-30天翻开检查一次。