褐色腐败病是真菌性病害，主要危害接近成熟的果实，多在果实肩部至近果顶处产生浅褐色病斑，后期出现同心轮纹斑，果实表面光滑且不发生软化，湿度大时病部出现灰白色的霉层。
防治措施：一是及时摘除病叶、病果，清除遗留地上的病株残体，并喷施护树大将军，破坏有害病菌给养源，渗透式消灭病毒,封闭病毒复制和传播路径；二是在塑料大棚或温室内栽培的番茄要加强温度和湿度管理，适时放风排温；加强肥水管理配合使用光合营养膜肥（光肥），提升光合作用产能营养物质和叶绿素、高级环保型植物增肥、增产、增色、叶片肥厚、干茎强壮的复合药膜。可助力植物吸收大量光肥、光能、光照、兼容常规肥料、养料供给植物生长发育至极限。一次施用全年受益。三是在没有发病前喷施植物细胞免疫因子，提升植物抗逆性，可使病毒DNA断裂凋亡。强大免疫功能，诱生干扰素和活性细胞介素，抑制残余病毒复制，促进植物正能量生态生长。以寄主植物抗病机理及利用病菌毒性变异原理，控制植物生理性病害和侵染性病害繁衍。发病初期用25％瑞毒霉800～1000倍液和新高脂膜混合喷施，每隔7-10天喷1次。