黄瓜根腐病是一种毁灭性土传病害，该病一般在结瓜期发病，蔓延快、为害重、损失大，发病率轻者30%-40%，重者70%-80%。黄瓜根腐病主要危害根部。
一、黄瓜根和根茎部受害症状：发病初期呈水浸状，后呈浅褐色湿腐，主根受害后引起根茎部缢缩，病部腐烂处的维管束变褐，但不向上扩展，可与枯萎病相区别。后期病部往往变糟，组织破碎，仅留下丝状维管束。病株地上部初期症状不明显，随病情发展中午叶片萎蔫，早晚恢复，严重的则多不能恢复而枯死，植株呈现青枯状。
二、黄瓜嫁接株受害症状：一般在摘心后至收获起发病。病情进展较慢，初期叶片失去活力，晴天中午叶片萎蔫，早、晚或阴天恢复原状，持续数天后下部叶片开始枯黄。用作砧木的黑籽南瓜茎基部呈水渍状变褐腐烂，引起全株枯死。