甜瓜成熟之后，有的往往有苦味，原因较多，具体原因有：一是氮肥施用过量，甜瓜成熟后易带苦味。二是低温寡照，特别是连阴多雨，甜瓜的根受到损伤，或活动受到阻碍时，吸收的水分少，果实生长极为缓慢，会在根系和果实中积累更多的苦味素。三是高温所致。甜瓜进入春末高温期（系指春棚栽培）或土壤湿度大，根系不太发达，吸收功能减弱，同化力降低，而夜间温度又过高，瓜生长缓慢，也会在瓜里积累更多的苦味素，形成苦瓜味。四是定植过晚，尤其大瓜龄苗移栽伤根严重，易造成苦瓜。五是坐瓜灵使用不当也会产生苦味。
防止苦味的几点措施：
1、不留根瓜。根瓜靠近植株根部，有效功能叶片少，营养条件较差，果实发育处于低温期，在光照不足和营养不良的情况下，容易使果形变小皮厚、味淡，食糖低，有苦味，所以要摘掉根瓜，一般苦味素多在根瓜上。
2、采光保湿。利用采光好、保温好、性能好的温室，有利根系发育。
3、适当稀植。合理密植，适当稀植，合理改善株间光照条件。
4、科学施肥。多施有机肥，尤其多施发酵好、腐熟好，并进行无害化处理的鸡粪和饼肥等优质有机肥，特别是不要过多施用氮素化肥。
5、降温控水。在植株进入衰老时期，通过降低温度，控制水分，和科学灌溉等措施，促进根系发育，生长发育良好。
6、控制温度。当甜瓜进入高温期，控制温度，即温度不能过高，尤其要防止夜间温度过高。
7、不能伤根。适时定植，在定植时和田间管理期间，不要伤根或尽量减少伤根，避免苦味的发生。