石榴采收后主要防治对象为桃蛀螟、桃小食心虫、刺蛾、金毛虫等虫害及干腐病、果腐病、褐斑病等病害。防治方法为结合修剪，采取以下措施。
刮老皮治干腐。为了防止干腐病等病菌的再侵染，在石榴采摘后，及时刮除老皮，并用护树大将军涂刷刮老皮后的树干，对树干有保护和防治病害的作用。同时，将刮掉的老皮火烧或深埋处理。全园再喷一遍护树大将军消毒杀菌。
树体喷药。石榴采摘后的10月中旬，若防治蚜虫与枣龟蜡蚧和榴绒粉蚧，可用杀虫剂进行防治。若蚜虫、枣龟蜡蚧、榴绒粉蚧、刺蛾、金毛虫等虫害一起防治，可用针对性的药剂+新高脂膜进行树体喷杀防治。