一、搭矮拱棚防寒或防晒：秋播木瓜播种后，一般10-20天幼苗的子叶陆续露出表土，应及时揭去覆盖的塑料薄膜，以免影响幼苗生长。这时应用竹片搭拱棚盖上塑料薄膜。
二、间苗补苗：当木瓜幼苗已长出2-3片真叶或更早，进行间苗及补苗。若育苗容器上多于1棵苗，应留壮的苗间除去多余的苗；缺苗的应及时从多苗的容器上移出补上。补苗应在没有北风的阴天进行，移植时带土，种植深度与原来深度一致。
三、施肥浇水：木瓜在秋冬季节育苗，因天气变化较大，降雨差异也大，水分管理要依天气情况和苗木生长进程而定。当木瓜幼苗长出4-5片真叶后开始喷施、淋施薄肥。一般用0.1%的尿素或0.1%的磷酸二氢钾水溶液喷施，或0.2%的复合肥水溶液淋施，每10天1次。