大豆根潜蝇主要在大豆苗期进行危害，食性单一，只危害大豆和野生大豆。幼虫在大豆苗根部皮层和木质部钻蛀危害，并排出粪便，造成根皮层腐烂，形成条状伤痕。受害根变粗、变褐、皮层开裂或畸形增生，幼虫的粪便和取食刺激韧皮组织木栓化，形成肿瘤，导致大豆根系受损伤而不能正常生长和吸收土壤中的各种营养成分。成虫刺破和舐食大豆幼苗的子叶和真叶，取食处形成小白点以至透明的小孔或呈枯斑状。
一、形态特征。⑴成虫：体长约3毫米，翅展1.5毫米，亮黑色，体形较粗。复眼大，暗红色。触角鞭节扁而短，末端钝圆。翅为浅紫色，有金属光泽。足黑褐色。⑵卵：长约0.4毫米，橄榄形，白色透明。⑶幼虫：体长约4毫米，为圆筒形、乳白色小蛆，进而全体呈现浅黄色，半透明；头缩入前腔，口钩为黑色，呈直角弯曲，其尖端稍向内弯。前气门1对，后气门1对，较大，从尾端伸出，与尾轴垂直，互相平行，气门开口处如菜花状。表面有28-41个气门孔。⑷蛹：长2.5-3毫米，长椭圆形，黑色，前后气门明显突出，靴形，尾端有两个针状须（后气门）。
二、生活史及发生规律
1、生活史：大豆根潜蝇1年发生1代，以蛹在大豆根部（大豆根瘤内）或被害根部附近的土内越冬，蛹期长达10-11个月之久。越冬蛹于翌年4月下旬地温逐渐升高、10厘米深地温达8℃以上，土壤湿度35%左右时开始发育，5月末至6月初羽化为成虫，羽化盛期为6月中旬。蛹在土层中深度越深，羽化率就越低。5月份气温高时，成虫出现要早5-6天，危害较严重。成虫羽化后2-3天即可交尾，当日就能产卵。一般在6月上旬开始产卵，产卵盛期为6月中旬。卵发育3-4天后开始孵化，孵化盛期为6月中下旬。孵化的幼虫沿茎下移。潜入根部钻蛀危害。幼虫期约20天，老熟幼虫于6月下旬开始化蛹越冬。6月末至7月初为化蛹盛期，蛹在土壤中存活时间达10个月之久。
2、发生规律：大豆根潜蝇的发生与环境条件密切相关，其发育的适宜温度为20-25℃。终霜期晚、气温较高、土壤干旱时发生轻于气温低、土壤湿度大的年份。肥沃地块比瘠薄地块危害严重。岗地比洼地危害严重，坡地重于平肥地，砂质土壤重于棕壤土，靠近草荒地和连作的地危害严重。茬口不同，大豆根潜蝇发生程度不同。重茬地越冬虫源数量较多，发生为害重；迎茬、正茬地发生较轻。秋季深翻或秋耢茬地块发生轻。秋季深翻20厘米以上，能把蛹深埋土中，降低羽化率，秋耢能把当年豆茬地地表下越冬蛹带到地表，经冬季长期低温和干燥的影响，死亡率增加。