菠萝蜜的栽培关键在于育苗。育苗也分为砧木苗的培育，和嫁接苗的培育两个不同的阶段。培育菠萝蜜的砧木苗，必须先选种，在沙床上播种催芽。每年的6-10月都可以催芽。大规模种植可以选在9-10月份进行。
菠萝蜜选种：催芽前的第一件事情当然是选种了。种子最好选择抗逆性和适应性强的本地菠萝蜜品种的种子。要选用从果实中剥离出来的新鲜种子，时间不能超过48小时。要求种粒成熟、饱满、外面光滑、无斑点。没有外伤，没有病虫的危害。用这样健康的种子，可以保证出芽率。选种完成后，再进行种子处理。
菠萝蜜洗种：种子处理的第一步是洗种。选出的种子应该立即放入清水中，用手搓洗最好搓洗2-3分钟。要洗干净。像这样搓洗两遍，将果粒上的果肉和糖分搓洗干净。清洗干净了种子再播种，就不会引来蚂蚁的侵害，也不会有其他病虫害的发生。
菠萝蜜种子杀菌消毒：洗种之后，要对种子做消毒处理。消毒杀菌药物选用多菌灵500-800倍液，在配好的药液中加入15千克清水，将种子倒入药液中，让种子浸泡2-3分钟。接下来做沙床催芽的准备工作。
菠萝蜜做沙床：沙床面积可以根据种子的多少而定。要选用细河沙做芽床。湿度要求为25%。用手握捏不粘手，还能立即地散开，这样的河沙才能算合格。先铺10-15厘米厚的沙土作为底沙，一定要铺平整，用薄木板刮平整就最好了。为了便于管理，一般做成10米长，1米宽的床面。
菠萝蜜催芽：铺好了底沙，将处理好的种子慢慢地铺呈在沙床上，要让种子散开，以免妨碍出芽。铺完了种子，我们在种子上覆盖一层面沙。厚度在2厘米左右就可以了。接下来，我们要在芽床上铺盖一层干枝杂草，以达到进一步遮阴保湿的目的，还有增温的效果。
菠萝蜜沙床管理：如果在18-30℃之间，催芽20天左右就可以了。如果遇到8-18℃的天气，催芽大概需要35天左右才行。要观察沙床的干湿状况，要及时淋水。淋水的次数不定，以保持土面的湿润为原则。等到出芽之后，揭开杂草。这时我们会看到幼芽已经长到3-5厘米这么高了。