1.整平土地、精细播种。播种前要把地整平，防止雨后大量积水。在地块周围有良好的排灌设施和条件，达到遇旱能浇，遇涝能排。遇旱情提倡先浇水后播种，反对播种后浇大量蒙头水。雨后及时排水，提倡雨后松土再播种。防止播种过深。
2.选择抗病性较强的品种。精选种子，剔除干瘪、受损、受冻的，选择大粒、饱满的种子进行播种，提高播种质量。
3.合理施肥。重视磷肥、钾肥、微肥的施用，特别是钾肥的施用。对于砂壤土地块、免耕直播田提倡同时施种肥或及早追肥。有机肥一定要发酵腐熟后再施用。玉米秸秆直接还田的，还田后要进行无害化灭菌处理。提倡玉米秸秆过腹还田。
4.加强田间管理。播种后遇大雨或浇蒙头水，应及时划锄松土，提高地温，提高土壤含氧量，利于根部透气，促发新根，同时抑制土壤中真菌的繁殖，减少玉米感病的机会。出苗后及时间苗定苗，培育齐苗壮苗，增加玉米苗期的抗病性。玉米苗期和制种田抗病力差，最好不使用玉米除草剂，特别是不抗苗枯病的品种。建议播种后先及时中耕松土，破除土壤板结，增强土壤的通透性，利于扎根，然后再喷施封闭式的除草剂控制杂草。
5.化学防治。可选择甲基托布津、多菌灵、恶菌灵、三唑酮等药剂，按它们的常规浓度进行施药，重点对苗基部进行喷雾或进行灌根，每隔5~7d喷1次，连续喷施2~3次，并且喷施叶面肥(天然芸薹素内酯、天达216以及磷钾肥、微肥等)，促进植株尽快恢复正常生长。