莲藕的主要主要病害有以下三种：1.是莲藕叶枯病病原是单丝壳属的病原真菌。主要危害荷叶，荷叶边缘先出现淡黄色的病斑，后逐渐向叶片中间扩展，呈黄褐色，最后从叶肉扩及到叶脉，直至全叶枯死。2.是莲藕叶斑病主要为害叶片，叶柄上有时也可发生，是由棒束孢属的病原真菌危害所致。3.是莲藕腐败病：一般在耕作层浅和水浅的老藕田及连作田易发病，影响结藕而减产。它是由藕球茎状镰状菌侵染后所致的莲藕病害，主要为害地下茎、地上部叶片和叶面。
防治措施。种植前用农资淘宝指南介绍的新高脂膜拌种（可与种衣剂混用），能驱避地下病虫，隔离病毒感染，不影响萌发吸胀功能，加强呼吸强度，提高种子发芽率。发病前可经常使用植物细胞免疫因子，提升植物抗逆性，可使病毒DNA断裂凋亡。发病初期，用75%百菌清0.5公斤、65%代森锌0.5公斤，加泥土30公斤拌匀后撒入浅水田内，并用农资淘宝指南介绍的新高脂膜+70%甲基托布津1000倍液、喷雾防治，每隔7-10天喷一次，连喷2-3次。