早熟木瓜8月初进入成熟期，要注意提前采摘，对中熟品种和晚熟品种的采摘可以根据加工出售时间适当提前或推迟采摘10-20天。
采摘时最好分级进行，如无虫害的一般作一级果，有虫害的作二级果，有病害的作三级果，这样加工时可首先加工三级果，然后是二级和一级。加工二级和一级果时，也可按果子的成熟程度确定时间采摘，这样可以提高加工产品的亮度和香度。
在加工药用木瓜时，一定要改变过去那种晒大块为主的旧传统。因为木瓜含大量的果胶和其它的有机养分，很难晒干，容易霉烂，严重降低药效。所以，提倡切小块或片状，在高温天气好的情况下，两天就可以晒干，能够确保优质药效。
在大西北地区，由于气候干燥少雨，适应于切大块，所以必须注意不同地区的气候，因地制宜，确保药用木瓜优质不腐烂。