一是要定期测量种子水分
为确保入库种子达到安全含水量，禾谷类作物种子安全含水量为12%%15%%，油料作物种子安全含水量为8%%10%，薯类作物安全含水量为65%—80%。在冬贮过程中，种子水分随环境温度和湿度的变化而变化，所以要定期测定种子水分，以防坏种。
二是要定期测定种子发芽率
要根据种子库存的情况，定期、定点、定层抽取种子样品进行发芽试验，特别是在种子入库前和出库前必须做发芽试验，以确保种子质量。
三是要经常检查种子病虫鼠害
要经常做好种子病虫鼠害检查，一旦发现要立即采取有效措施，如喷施药剂和清洗加工等方法，尽快清除病虫鼠害。
四是谨防突然变化温度
在贮藏种子过程中，一般在室外贮藏的种子不能突然转到室内，同样，在室内贮藏的种子也不能突然转到室外，否则温度的突然变化会大大降低种子的发芽率。
五是要注意忌与农药、化肥混合贮藏
忌用塑料袋装种子，忌烟气熏蒸；忌种子与地面直接接触等。