一、农业防治
1、选种:一般情况下，杂交玉米种比常规种抗病性强。选用高产、优质、抗耐病的品种是防治大小斑病的根本错施。此外，玉米品种的抗病性与种植年限、海拔高度等有着密切关系，在选用抗病品种的同时，搞好品种合理布局或品种轮换，也是防治玉米大小斑病的重要措施。对于多种病害混合发生区应选用多抗品种，以防顾此失彼。
2、减少菌源:在玉米收获后彻底深翻，将病残体埋入土中，加速病菌分解。用玉米秸秆作堆肥时必须经高温发酵杀死病菌.以玉米秸秆为燃料的地方，尽可能在玉米播种前将玉米秸秆烧掉。实行大面积轮作，既有利于玉米生长发育，又能减少菌量积累。大面积发病时及时摘除下部病叶，维护病害流行，减轻危害效果。
3、加强栽培管理:适时早播可以使玉米提早抽雄，错过夏季7-8月份的多雨天气，尤其是夏玉米避雨和避开病害对玉米增产具有明显作用。海拔1500米以上的山区在4月上、中旬播种较为合适；海拔1500米以下的山区、半山区在4月下旬至5月初播种较为合适。同时，推行玉米与陆稻或大豆等作物间套种，增加通风透光，可减轻玉米大小斑病的发生，增加产量。推广使用多菌灵、粉锈宁等药剂拌种处理玉米种子，尽可能避免种子带菌。总之，推广宽窄行种植技术，改善通风透光条件，与矮秆作物进行间作套种，或合理密植大垄双行，做好中耕除草和培土工作，降低田间湿度，改善田间小气候，适期早播、均衡施肥等均能减轻危害。
4、加强肥水管理:玉米为喜肥作物，应施足底肥，适时追肥。偏施氮肥，植株嫩绿，有利于病菌侵入危害；增施磷、钾肥可提高植株抗性。钾肥能提高植株硅质化程度，增强抗病力；磷肥能提高植株抗病性、抗寒性和抗旱能力。苗期、大喇叭口期各施一次氮肥，防止后期脱肥，亩施农家肥1000—2000公斤，配施磷、钾肥，每亩可增施普钙10公斤，硫酸钾10公斤，保证植株生长健壮，增强田间抗逆性，可有效抑制和减轻大斑病的发生与危害。
二、药剂防治
病情扩展前防治，即玉米抽雄后，田间病株率达70%以上，病叶率20%时喷药。防治较好的药剂种类有：50%多菌灵可湿性粉剂500倍液；20%粉锈灵可湿性粉剂500倍液；50%敌菌灵可湿性粉剂500倍液；70%甲基托托布津500倍液或65%代森锌可湿性粉剂500倍液等。每亩用药液50—70千克，隔7—10天喷药1次，共2—3次。