有机花椰菜的耐涝能力较差，在多雨地区及地下水位高的环境条件下种植花椰菜，都应该采取深沟高厢的技术措施，以利排水，这是栽培花椰菜成功与否的关键所在。花椰菜亦忌连作，前作以瓜类、茄果类、豆类蔬菜为宜，应选择肥沃的壤土及粘壤土作大田栽培。重施底肥，亩用腐熟农家肥3000公斤，磷肥50公斤，钾肥20公斤尿素25公斤均匀撒施后翻耕，做厢。秋花椰菜可4米开厢，早熟品种栽8行，晚熟品种栽6行。
有机花椰菜定植应在阴天或晴天下午进行，定植后浇透水。移栽不宜太深，以营养抔土与相面土平行或略高即可，施足定根水。如果遇到久晴土干，最好在移栽前将厢沟灌足水，并把厢面浇湿，以利于降低土温。
在缓苗后中耕1次，并浇水。如果遇到雨水太多，田块湿度太大，就要多进行中耕，保持根部的干燥和疏松透气。往往很多花椰菜田由于太湿而引起生长缓慢，甚至停止生长。花椰菜田既要经常保持湿润，又要及时松土并除草。
有机花椰菜在苗期和大田高温、高湿条件下易发生霜霉病，可喷施百菌清、代森锌、瑞毒霉、杀毒凡、克露、安克等药剂防治。花椰菜生长期易发生菜青虫、小菜蛾、黄条跳甲等虫害，防治可用溴氰菊酯、杀虫双、毒死蜱、锐劲特、阿维菌素、Bt、农地乐等药剂。