一、选用优良香蕉苗，不从病害区引进种苗。
二、在香蕉园内及附近不宜种瓜类、豆类、茄科等蔬菜。
三、在蚜虫及花蝽发生期（3~4月，9~11月）及时杀灭害虫防止传播，可用药剂：40%乐果乳油800倍液，50%抗蚜威可湿性粉剂1500倍液，10%毗啉可湿性粉剂3000―4000倍液，20%康复多浓可溶剂6000―8000倍液喷雾。
四、在香蕉园发现有香蕉花叶心腐病病株时，应立即将整丛蕉株连同吸芽和蕉根彻底挖除，见一株挖一株，集中销毁，用普乐等杀虫剂喷杀交脉蚜，彻底消灭传毒媒介。同时加入800倍液的强力克病毒、菌毒清和生多素或多元核苷酸等生长调节剂喷洒，提高植株免疫力，促进健康生长。