茄子的茎为圆形，茎外皮的颜色与果实、叶片的颜色有相关性，一般果实为紫色的品种，嫩茎和叶柄也为紫色，白茄和青茄茎的颜色均为绿色。可以在苗期根据茄茎的颜色判断茄子的果色，易于剔除杂株杂苗。随着植株长大，茎逐渐木质化，成株的茎基部木质化程度比较高，直立性较强，因而能够承载地上部植株和果实的重量。大多数情况下，只要及时采收商品果，植株就不需插杆支撑。只是作采种用的植株，或保护栽培的植株，由于植株高大易倒伏，则需支架。
茄子的分枝习性为假二杈分枝，当主茎长到一定节数时顶芽变成花芽。而顶芽下面的两个侧芽抽生侧枝，代替主茎生长。两个侧枝几乎均衡生长，构成双杈分枝。侧枝长出2～3片叶后，顶芽又形成花芽，下面两个腋芽又依同样方式形成侧枝。以后每隔2～3叶形成花芽，又分枝一次。分枝能力强，茎的高度和直立程度、分枝性，不同品种之间差异很大。按果实出现的顺序分别称为门茄、对茄、四门斗、八面风等。从结果习性看，茄子前期结果少，产量低，以后数量成倍增加，产量也随之迅速提高，有很大的增产潜力。但在保护地栽培中，这种分枝习性，如任其自然发展，会造成田间郁闭，通风透光不良，病害严重，产量和质量下降。因此，在保护地栽培中，要进行科学整枝。茄子枝条短截后，隐芽会萌发，再次开花结果，这就为茄子整枝更新提供了可能。试验证明，不同的整枝栽培方式，茄子的产量会有较大的差别。