水稻病虫害在妥甸镇不同程度每年都有发生，特别是麦地新、大敌鲁、新会、小村、窝碑为多发生地带，随着科技推广，人们的思想认识也逐渐提高，通过良种良法的推广，病虫害逐年减少，在一定程度上得到了控制，以下是几种常见病虫害的防治方法：
1、粘虫的防治方法：亩用50%敌敌畏乳油1000－1500倍液喷雾50－60公斤药液，或用氯青菊脂1500倍液喷雾。针对粘虫和稻飞虱混合发生的田块，可选用10%蚜虱净30克50%敌敌畏乳油30－40毫升兑水50－60公斤，进行喷雾。既可防法粘虫又可兼治稻飞虱。或用吡虫啉1000倍液喷雾。
2、稻瘟病的防治方法：亩用75%的三环唑50－80克兑水50－60公斤，进行喷雾，每隔7－10天喷施一次，在水稻抽穗期，亩用100克重防一次。或用稻乐1000倍液喷雾。
3、白叶枯病的防治方法：亩用20%的叶枯宁粉剂200－250克兑水50－60公斤喷雾，均有较好防治。
4、稻飞虱的防治方法：用吡虫啉1000倍液喷雾。