小麦赤霉病是气候性病害，可导致小麦品质下降，感病麦粒带有毒素，可使人畜食后中毒。同时小麦一般减产20%左右，病重时可减产50%以上。并且感病具有隐蔽性，防治时间短。所以防治时应注意：
1、天气：气温平均15度以上、有3天以上连阴天、或有雾，就要进行防治。
2、防治时期：小麦田间抽穗率50%左右，或杨花1%时施药。
3、药物选择：每亩50%多菌灵100克或30%多.酮100克或5%己唑醇15毫升或36%甲基硫菌灵50克。
4、施药方法：每亩药物兑水30-50公斤，对准穗部均匀喷雾。
5、由于防治一次效果不高，特别是田间湿度大的天气，7-10天后再防治一次效果更好。