1、种植抗病品种，种一般耐旱品种较抗病，马齿型玉米较甜玉米抗病；早熟种较晚熟种发病轻。
2、减少菌源，由于种菌源是发生黑粉病的根本条件，所以在防治黑粉病的大面积发生，减少菌源是必要的措施。一是可以通过轮作耕种，一般病菌在土壤中都可以存活2年以上，所以可以采取3年为一个周期的轮作耕种，尽可能避免连作，更要避免连作同一品种，品种轮换对于防止黑粉的发生有一定的效果；二是进行药剂防治，播种之前先要对种子进行精选，保留大小一致，籽粒饱满、品相的好的种子。在种前，用种衣剂进行拌种，晾干后播种，在选择时，要尽可能选择那些内吸性强，残效期长的药剂。有些种衣剂还含有一定量的微肥，对于以后幼苗的生长有促进作用。
3、加强田间管理一是要适时播种，控制好播种的深浅，促进早出苗，减少感染的机会，在苗期要加以肥水的管理，适时补充水肥，保证植株的健康生长，提高自然的免疫力，保证营养充足，氮磷钾配合施用，要科学合理，尽量要避免偏施氮肥，防止幼苗徒长，灌溉要及时，在抽雄期易感病的阶段，要保证水分的充足供应；二是如果田间发出有病株出现时，初期要及时把染病苗拔掉，并带出田间，最好是深埋，防止冬孢子扩散，引发再次的感染，后期及早割除菌瘿，以减少当年的再侵染菌源及次年的菌源。秋季玉米收后，要进行秋翻，把田间的病残体清理干净，然后进行深翻处理，把带菌的土壤翻到地下，避免冬孢子在空中扩散，同时结合翻耕，施用充分腐熟有机肥，增强地力，壮苗健苗。在抽雄前适时灌溉，勿使这个时期植株受旱，也要注意防止旱涝不均的情况发生。