西红柿在生长过程中易受到菌类病害的侵害。例如，叶枯病是西红柿中较为常见的病害之一，主要表现为叶子边缘干枯、卷曲，严重的还会导致叶片脱落；黑星病也是西红柿易患病害之一，主要表现为叶片上出现小黑点，严重的会导致叶片枯黄、掉落，同时还需要注意西红柿早疫病、晚疫病等病害的防治。
气候环境的变化也是影响西红柿生长的重要因素之一。高温、干旱的天气会导致西红柿花药开放不畅，造成萎蔫、花朵脱落等现象；寒冷、潮湿的环境则容易导致西红柿的根部腐烂，影响西红柿的生长。
西红柿还容易受到虫害的影响。例如，红蜘蛛、斑点潜蝇等害虫会在西红柿上产卵，使得西红柿表面出现斑点，影响美观度和口感。而白粉虱、蚜虫等虫害则会吸食西红柿汁液，导致西红柿的生长受阻。