选择抗病品种是防控水稻矮缩病的基础。根据不同的地区和气候条件，选择具有抗性的品种可以有效地预防病害的发生。在选种的过程中，应该注意种子的来源和质量，以确保种子的纯度和卫生状况。
加强水稻田地的管理，保持田地的干燥和通风，避免过度浇水和病原的传播。在田地种植前，应该彻底消毒，并清除田间杂草和残留物，以减少病原体的滋生和繁殖。
此外，加强病害监测和防治工作也是很重要的措施。及时发现病害的迹象，进行病源菌的检测和病害的诊断，以便及时采取措施进行防治。在防治过程中，可以使用生物防治、化学防治和物理防治等多种方法，针对不同的病害类型选择相应的防治措施。