从根源上预防。小麦茎基腐病的发生与土壤肥力不足有关，因此应注意保持土壤肥力，采用适宜的施肥措施，并使用农家肥等有机肥料进行施肥。此外，春季要对土壤进行消毒处理，以杀死病原菌，避免小麦茎基腐病的发生。
加强田间管理。春季小麦生长发育迅速，需要适量浇水，但要避免过度浇水和闷湿，以免造成病害的滋生。同时，注意保持田间通风和灌排畅通，以避免空气湿度过大，给小麦茎基腐病的传播创造条件。另外，同时注意留意天气预报，及时采取防雨措施，避免连续降雨造成的病害爆发。
及时发现和处理病害。春季小麦茎基腐病的病害症状一般为茎基软化、叶片枯黄等，如发现病害应及时处理，对已经出现病害的植株要采取适当的剪枝、防病治疗等措施，以避免病害进一步蔓延和对其他植株的影响。