联合收割机故障产生的起因主要有两种：一是由于操作不当引起的意外性故障，是人为所致，一般是容易避免和预防的。二是机器长期使用中某些机件由于过度磨损而引发的突发性故障，是自然磨损所致，在使用中只要采取积极的防范措施是可以避免和减少故障发生的概率。下面是几种典型的故障发生原因及预防方法：
1.切割刀片损坏
在切割过程中遇到石块、树根等硬物；护刃器松动或变形，使定刀片高低不一致；刀片铆钉松动，切割时相碰等都可能引起切割刀片损坏。为预防刀片损坏，操作时应注意切割器前面的障碍物，防止刀片切割铁丝等硬物，或者与石块、电线杆、木桩等相撞。保养时，要经常检查和调整护刃器，使定刀片在同一水平面内，松动的刀片要及时铆紧。
2.刀杆折断
主要因为割刀运动阻力太大或割刀驱动机构的安装位置不正确。为预防刀杆折断，应正确调整切割器，使割刀运动阻力减小，同时调整割刀驱动机构安装位置，以达到装配要求。刀杆折断后，应更换备用割刀，并对折断刀杆进行修复。麦收过后，卸下的割刀应放在库内平架上或垂直挂在库内的梁上，避免刀杆弯曲变形。
3.割台螺旋推运器打滑
推运器的螺旋叶片与割台底板的间隙过大，尤其是在收割稀矮小麦时，叶片抓不住已割作物，不能及时输送，在推运器前堆积、堵塞，引起割台螺旋推运器打滑。为预防此故障的产生，应根据作物的稀密、高矮等不同情况，正确调整好螺旋叶片与割台厢板的间隙；当叶片边缘磨光时，会降低推运效率，可用扁铲或锉刀加工出小齿，以提高其抓取和推送能力。
4.滚筒堵塞
作物太湿、太密，杂草多；行走速度过快；脱粒间隙小，或滚筒转速低；传动皮带打滑；发动机马力不足；逐稿轮和逐稿器打滑不转；喂入不均等都能引起滚筒堵塞。为了预防滚筒堵塞，在收割多草潮湿作物时，应适量增大滚筒与凹板的间隙；当听到滚筒转速下降音时，应降低机车前进速度或暂时停止前进；调整传动带的紧度；正确调整滚筒的转速和逐镐器木轴承的间隙。若滚筒堵塞，应关闭发动机，将凹板放到最低位置，扳动滚筒皮带，将堵塞物掏净。
5.滚筒脱不净
主要是由于滚筒转速过低、凹板间隙过大、作物喂入量过大或喂入不均匀；钉齿、纹杆和凹板栅条过度磨损，脱粒能力降低，或凹板变形造成脱粒不净；收获时间过早，作物过于湿润，脱粒难度大，致使脱粒不净。针对以上故障可提高滚筒转速，减少凹板间隙，或降低联合收割机前进速度；更换钉齿、纹杆、凹板；适当提高滚筒转速和减少喂入量，可提高脱净率。
6.筛面堵塞
主要因为脱粒装置调整不当，碎茎杆太多，风扇吹不开脱出物，使前部筛孔被碎茎杆、穗“堵死”，而引起推运器超负荷或堵塞；清洗装置调整不当，筛子开度小，风量小，风向调整不当，筛子振幅不够或倾斜度不对，造成筛面排出物中籽粒较多，清选损失增大；作物潮湿或杂草太多，以致伴随清洁度降低。针对以上故障则应适当减少喂入量，降低滚筒转速或适当加大脱粒间隙，提高风量和改变风向，调整筛面间隙，以改善筛面和推运器的堵塞；调节筛子开度和风量；改变尾筛倾斜度，增加滚筒转速等。
7.链条断裂
链条松紧度不合适；链条偏磨；传动轴弯曲，使链轮偏摆；链条严重磨损后继续使用；链轮磨损超过允许限度；套筒滚子链开口销磨断脱落，或接头卡子开口方向装反；钩形链磨损严重或装反，都会造成链条掉链、断裂和脱开。为预防此故障的产生，必须使同一传动回路中的各链轮在同一转动平面内；经常检查链条的磨损情况，及时修理和更换；经常检查链条接头开口销的情况，必要时更换；矫直弯曲的传动轴，使链轮转动时不超过允许的摆动量；正确调链条的松紧度；及时修理和更换超过磨损限度的链轮，正确调整安全离合器；及时润滑传动链条。