存放前清洗干净
大多数农药对喷雾器有腐蚀的作用，因此使用后要及时清洁。喷雾器停用后，首先把药液桶、胶管、喷杆、打气筒等部件壳擦洗干净。其次再用碱水洗涮一遍（喷过波尔多液的喷雾器最好用碱水浸泡1~2小时）。最后用清水冲洗干净并用棉布擦干，切忌曝晒。
涂优质润滑脂、刷漆防锈
能拆卸的部件要拆下来清洗干净，喷杆、喷头的内管壁用机油冲洗，以免受潮生锈。凡是螺丝固定的部位或经常受到要磨损的地方，都要涂上优质润滑脂（黄油）。薄壁铁制件，可把调好的油漆均匀地刷在其表面或掉漆部位，可确保长时间不生锈。
防止橡胶件粘上油类
在喷雾器金属部件上涂油类防锈时，应注意避免橡胶件上粘上油类。因为橡胶件粘上油类，容易老化，产生裂纹，缩短使用寿命。
放在通风、干燥、不受阳光直射的仓库
喷雾器不要放在阴暗潮湿的角落里，也不要露天存放，应放在室内通风、干燥及不受阳光直射的地方。因为喷雾器上有许多部件是用橡胶和塑料制成，这些制品受空气中的氧气和阳光中的紫外线作用，易老化变质，使橡胶件的弹性变差或折断。
喷杆断裂或喷雾器外桶裂缝要修补
发现喷杆断裂或喷雾器外桶裂缝，可购买PSI速成塑料胶棒或其它塑料修补胶修补。先将修补处清理干净，消除油迹，并使表面粗糙化。取出管中速成塑料的胶体，切下所需的用量，将速成塑料的胶体内芯与外皮两种不同颜色的材料用手充分揉合呈一色（约1~2分钟）即可使用。如遇低温条件下使用不易揉合，可将胶体适当加热至室温或稍高于室温后使用。
防小动物啃咬
许多农户的喷雾器在存放过程中被老鼠等小动物啃坏，因此，喷雾器要存放在无虫害、鼠害的地方，最好悬挂在仓房内的墙上。