防止水垢产生的最有效方法是避免使用硬水，冷却水应进行软化处理，可将硬水煮开后等沉淀物析出后即成为软水。也可用软化剂软化．软化剂的配方为（重量比）：蒸馏水：磷酸三钠：氢氧化钠：碳酸钠：烤胶=3：0.35：0.11：0.5：0.04。
在应用时8～30度的硬水100公斤水内加13克软化剂，30度以上的硬水，100公斤水内加入19克软化剂。
另外，雨水、雪水、大的江河里的水含矿物量较少，澄清后其性质接近于软水。如果冷却系中已形成超过1毫米厚的水垢，就必须进行清洗。柴油机作业完毕，趁热放水，将先已配好的清洗液加入冷却系中保持10～12小时，然后起动运转半小时左右，使温度达到70～90℃。放出清洗液，再用清水（最好软化处理过）进行清洗。对采用开式冷却系的柴油机，应先将清洗液放入铁桶内，把冷却系中的水放尽后，再把吸管放到盛清洗液的铁桶内，让清洗液在冷却系中循环，运转7～9／小时后放出，随即用清水清洗。清洗液的一般配方为：10公斤水加煤油0.15公斤、氢氧化钠0．75公斤，混合均匀后使用。也有的是9公斤水加1．7公斤磷酸、0.5公斤铬酸酐，搅拌均匀后使用。如柴油机的缸盖是铝合金的或水箱是铝制的。不能用上述清洗液清洗，因为铝很易被上述清洗液腐蚀，可用水玻璃0．15公斤、液态肥皂0.02公斤、水10公斤配成清洗液使用。清洗前，先将节温器拆下，清洗后再装复。