柴油发电机在工作的时候，会产生大量的热量，需要冷却水对柴油机进行冷却。
冷却水将柴油机的热量带走，同时从柴油机出来的高温冷却水也需要一种冷却水媒介冷却它，一般常用的方法有两种：一种是柴油机带动之风扇对水箱内高温的冷却水进行冷却，俗称风冷：另一种是通过水池或冷却塔的水来冷却柴油机内部的冷却水，俗称水冷。
风冷和水冷个有所长，我们可根据其使用环境做作出选择，一般机组需要经常搬迁，宜选择风冷，若机组长期固定不动，则宜选择水冷。选择水冷，因为拆卸了风扇和冷却水塔，可以降低机组噪音噪音10分贝左右，同时，风扇所消耗的功率约为机组额定功率的5%，一般在天气炎热的地区，柴油机水温往往超出额定范围，从而造成柴油机高温运行，而冷却水塔则可以认为的控制水温高低，风冷则受限制。
冷原理如下：
柴油机工作时产生的热水从柴油机的出水管流到热交换器，热交换器的冷却管内的冷水冷却柴油机的循环热水，柴油机的循环热水被冷却后重新回到柴油机，并对柴油机进行冷却。热交换器冷却管内的冷水在冷却柴油机的循环热水后水温升高，被泵到冷却塔进行冷却，冷却后送到热交换器的冷却管。柴油机的水温可通过调节水阀的开启进行调整，过滤网对冷却塔出来的冷进行过滤，然后再进入热交换管内。水冷工程可保证柴油机在85-90摄氏度的最佳水温工作。