水稻育秧有以下特点：
1、机械化育秧实现育秧与移栽无缝对接
机械化育秧是流水线生产，生产效率高、作业质量好，它的规模化生产可以根据移栽时间、移栽能力等综合条件来控制秧苗的成苗时间，以便农户合理安排进行大田泡水和插秧时间。可避免传统育秧出现的苗等田或田等苗现象，实现了育秧和泡田、插秧的无缝对接。
2、减少土地破坏，节约成本，转移劳动力
传统水稻育秧需要从大田中取走大量土壤来作营养土，多年的连续取土则会造成田中的熟土层越来越薄，土地营养越来越不足。机械化育秧则避免了从田中大量取土的缺点，采用基质育秧减少土地破坏，并且在泥土购置、肥料使用等方面都节约了成本。基质机械化育秧节约了大田取土的用工量，解省了劳动力，使得劳动力转移到其他领域，变相地增加了农民收入。
3、减少环境污染
传统的育秧所废弃的菌包露天堆放，容易造成环境污染。机械化育秧后，使得蘑菇废包的氮鳞钾等成分经过长期分解，更容易被作物本身吸收。如果将入生畜粪便、作物秸秆、谷粉等加入粗纤维丰富的蘑菇包，经过沤制、发酵、添加有机质后就变成有机肥料，这不仅变蘑菇包为宝，还解决了环境污染的问题。