小麦、水稻丰收完成后，联合收获机需要进行维修和保养，才能维持机械性能，在下季和来年的收割中更好的发挥作用。
滚筒室、绞龙和吸风管道、分离、扬粒室很有可能残留杂物，需要拆卸防护装置进行清除，除此以外，割刀、割台、行走链条、链轮、轴承、拨禾器、三角带、三角轮、发动机外表等地的残留秸秆杂草和泥土等也需要清理。清除干净后启动机器，让工作部件保持高速运转3～5分钟，把残留物排出，之后用水冲洗机器外部，再启动机器3～5分钟排干水分。加上润滑油，空机运转1～2分钟，放出发动机的柴油或汽油，检查机油是否更好；紧固连接螺栓；放入干净的室内保管。
对各部位的零件进行检查和保养，主要有链条、脱粒滚筒、紧固件和传送皮带等。如果发现变形变质或是松动等异常情况，需要及时维修更替。
对照联合收割机的润滑图、润滑表和柴油机（汽油机）的说明书，对整机内部进行全面润滑。润滑后以中小油门空转柴油机5～10分钟。若机器的外部有脱漆现象，需补刷油漆，以免生锈。
调整各调解处的螺纹，涂上润滑脂，把拔禾轮、割台降到最低位置，升降柱塞杆缩入油缸。最后，要将保养好的机器放置在阴凉干燥处，最好用东西遮住，以免落灰。