使用旋耕机打地，翻地深度只有15-20厘米，连年使用旋耕机翻地会导致耕作层变浅，严重影响蔬菜长势。加上重茬等日益严重，很多菜农反映大棚蔬菜秸秆变细了，长势变弱了，产量变低了。针对当前情况，菜农一般是采取增施生物菌肥、抗重茬剂等来改良土壤，但这样的措施却是治标不治本。
寿光市稻田镇南慈村菜农慈志群选择了用小型挖掘机深翻土壤，结合生物菌肥改良土壤，效果十分明显，定植后的西红柿长势强，棵子粗，植株健壮，整体抗病性增强，产量也明显提高。
慈师傅说：“用改装后的小型挖掘机深翻棚地，去年在我们这边还算是新鲜事，开始时没人愿意用，费用挺高。后来听说大棚深翻有利于解决死棵，我自己也认根深叶茂这个理，于是就在棚内用铁锹深翻了四个空做实验，大约在40cm的深度，结果在同样施肥管理的情况下，这片的西红柿死棵少，长势旺，叶片厚实，抗性提高，果实坐果量和单重增加。”
深翻土壤好处确实很多，不但可以打破犁底层，增加耕作层厚度，促进根系深扎，提高蔬菜抗逆性，而且可以将深层土壤翻至表层，浅层土壤翻到深层，从而也将大量的病原物埋入深层土壤，降低了其为害，效果极为明显。而我们往常所说的深翻，多是人工用铁锹深翻，费工费力，而且当前雇工费用越来越高，这种累活找人也相对困难，已经很少有菜农人工深翻。慈师傅在去年6月份，撤掉棚膜，找来小型挖掘机，深翻了这个大棚。近两市亩棚翻地总共花了1600元，花费还是较高的。
这种小型挖掘机进棚前得先开挖入口，在大棚前脸处，挖大约3米宽即可进入棚内。挖掘机进入棚室以后，先在前脸处沿东西向深翻，这里是棚内最矮的地方，操作起来比较费时。操作时挖掘机为倒行，挖出的土则向前翻，以免压实刚翻好的棚地。如果土壤偏干，挖出的土块较大，可用大铲粉碎一下。挖掘机在棚内“回”字运行。一般情况下，这种挖掘机每天可深翻棚地2000平方米左右。