拖拉机变速箱的齿轮经常在高转速、高负荷情况下工作，而且变速箱齿轮所承载的转速和负荷又是在不断变化的，所以齿轮损坏时常发生。变速箱齿轮除了正常磨损外，还会因齿轮本身质量差、变速箱内严重缺油及箱内混进其他金属物、驾驶操作不当、维修时齿轮装配相互啮合位置不当等原因造成变速箱齿轮加速损坏；另外，一般性齿轮磨损都是由于年久失修，轴承、齿轮磨耗后径向间隙增大，齿轮啮合传动不正常，造成齿轮冲击，加速齿轮的磨损和损伤。拖拉机变速箱齿轮非正常磨损或损坏的原因有以下几个方面。
一、变速箱齿轮损坏原因
1．变速箱正齿轮
变速箱正齿轮损坏部位多在两齿端接合处，或呈现斑痕，或轮齿短缺。这是由于驾驶员操纵变速杆时无良好的操纵方法，常年强制挂挡而造成的。两齿轮旋转的速率不同，齿轮与齿轮接合时相互撞击使齿端头严重损耗而损坏。中间轴和第二轴上的正齿轮牙齿脱落（打牙）是因齿间啮合间隙过大，或啮合不完全，也就是换挡后两齿轮牙齿只接触一半或更少一些，此时驾驶员将变速杆、油门踏板、离合器踏板三者配合不当，致使齿轮面上的垂直压力增大而打牙。或者是车辆用二、三挡全负载上坡时跑挡，驾驶员采取硬推排挡的方法，使齿轮与齿轮单边啮合传动，导致牙齿损坏。
2．变速箱常啮合齿轮
变速箱常啮合齿轮不易打牙，如五个前进挡的主动齿轮和从动齿轮、第二轴三挡齿轮和中间轴三挡齿轮，第二轴四挡或五挡齿轮和中间轴四挡或五挡齿轮等。但这些齿轮长期带负荷旋转容易磨损，过度的磨损也会造成轮齿脱落。通常三、四挡或五挡齿轮都是代有套齿和套牙的，当套齿和套牙接合后，第二轴上的齿轮和轴就成为传动体，中间轴上的齿轮传动力就集中在两传动轮齿上，故常啮合齿轮也有轮齿脱落的可能。主动齿轮与从动齿轮的常啮合传动虽然不受换挡的影响，但如主动齿轮的轮齿因磨损而过薄，当换低速挡负荷加重或离合器接合过猛时，就会发生轮齿脱落的现象，这是因为两齿啮合间隙过大，在齿面上产生冲击力过重的缘故。
3．怠速齿轮
一般在平路上行驶的车辆怠速齿轮只在倒车时使用，一挡齿轮甚至二挡齿轮都在车辆起步时使用，故这些齿轮的损坏率较低。山区行驶的车辆条件就不同，车辆常常满载挂一挡行驶在几十公里的盘山道路上，车辆使用一挡、倒挡更为频繁，故这些齿轮的损坏率较高，往往中间轴一挡齿轮的齿面严重磨损甚至轮齿脱落，第二轴一、倒挡挂挡齿轮节圆直径比较大，牙齿不易磨损和脱落，但齿轮滑键槽部分容易磨损，变速箱后轴承的磨损也随之加重。
齿轮牙齿的磨损促使滑键槽部分的磨损，也加快了变速箱后轴承的磨损。反之，滑键槽及后轴承的磨损又给齿轮牙齿磨损和脱落创造了条件。这就是说，变速箱后轴承磨损松旷后产生了轴的径向跳动，加之滑键槽磨损松弛，则齿轮旋转空量较大，致使轮齿在转动中相互碰击，在车辆换挡负荷加重时发生轮齿脱落的现象。为此，损坏的一对齿轮换新后必须同时更换后轴承（包括中间轴后轴承），并检查第二轴滑键部分磨耗程度。只更换新齿轮是不能从根本上解决问题的。
4.齿圈及套齿
主动齿轮外齿圈、四挡及五挡齿轮外齿圈、三挡齿轮外齿圈等亦称为套牙，与这些外齿圈配合的内齿圈亦称为套齿。有一些车型的变速箱将内齿圈及外齿圈相反设置，亦称为主轴四、五挡滑动齿轮。这些套牙、套齿及滑动齿轮是挂挡齿轮，实际上它们是一种齿轮同轴的接轴器，也是轴与轴的接合器。它们的外径较小、齿数较少、齿长较短，套牙与套齿接合后的旋转是同步的，故磨损率比较低。尽管如此，由于四、五挡及三挡是车辆使用的经济挡位，使用率占全车使用挡位的70％以上，所以损耗还是较快的。
二、预防措施
1．各种型号拖拉机齿轮，都是按一定负荷设计的。如果工作中长期超负荷，作用力超过了材料的许用应力，会造成轮齿折断、变形。为此，拖拉机在工作中要选择正常挡位和负荷。如果拖拉机超负荷作业，会使变速箱、后桥齿轮负荷增加，缩短齿轮的使用寿命。
2．修理中需要更换齿轮时，应成对更换，如果只更换磨损较严重的齿轮，则两轮齿啮合时接触不良，使它们不能正常工作，会加速新旧齿轮磨损。
3．新齿轮装配后，在投入使用前应进行充分的磨合，严禁不经过磨合就进行生产使用。新齿轮在经过加工后齿面都存在着凸凹不平，即存在着表面粗糙度差，表面粗糙使齿面的接触质量下降，经过试运行的跑合能有效地降低表面粗糙度对轮齿接触质量的影响，通过跑合的齿轮能有效地改善齿轮表面的接触质量，即能有效地提高承载能力、提高耐磨性能。因此拖拉机、农业机械维修后都要按试运行操作规程认真磨合，严禁更换新齿轮后立即投人作业，并在试运转后要放掉润滑油。