(1)机具启动
使用三相电源，起动后观察电机旋转方向是否正确，观察其工作电压是否符合要求，一般应在标定值±10%变化;使用单相电源的，应检查线路和输电设备容量是否足够。燃烧器点火不着，稍停片刻再点火，如三久ACF型烘干机第一次点不着火，要求过30s钟再按“再点火”键，再按“干燥”键。
(2)进料要求
进入烘干机的谷物，含杂一般应小于2%～3%。含杂较多，除谷物有效烘干量减少、能量浪费外，还会发生架空、循环不匀、甚至堵塞等操作故障，严重时进谷困难。对含杂较多的谷物，一定要先扬清。小型全喂入式联合收割机收获的水稻，清洁度一般在95%左右，须经扬清才能进入烘干机。每批次装谷不能超过额定容量，否则会堵塞或损坏电机;但也不能过少，否则加热气流逃逸及谷物循环失调。
(3)干燥温度
当进行种子干燥时，谷温应保持在40℃下，保证其发芽率。食用粮烘干，要使谷物品质不受影响，谷温掌握在不超过50℃为宜。现在多数烘干机仪表反映的不是谷温，而是进风温度。进风温度要根据谷物品种、装机谷物数量、外界气温来正确设定。当谷物量多、外界气温高时，进风温度相应要高些，具体应按说明书规定的方法选取。上述选定的进风温度值，如遇气候干燥，或待干燥的谷物已经过熟、脱壳米较多、易爆腰品种时，可降低2～4℃。反之，气候阴雨潮湿时可提高2-4℃。少数机(如金子SSA型)有自控程序，能根据气温、湿度和干燥程度而自动调整。
(4)脱水速度
风量大、风温高、装机谷物少，脱水速度就快，但谷物爆腰率上升。因此要按规定操作，使脱水速度控制在设计范围内。批次循环式烘干机小时脱水率都在2%以下，有的机型不超过1%。谷物在烘干机内循环过程中加热是断续的，在最大额定装谷容量下，一个循环时间在lh左右，其中约1/4时间加热，另3/4时间为不加热的缓速干燥阶段，使谷粒内层水分向外层扩散，减少爆腰。对于不同含水率谷物同批次干燥，可采用二阶段干燥，即在脱水至18%含水率时，停止作业5h以上，然后再继续干燥至进仓水分。也可采用常温风干后再进人连续热风干燥。
(5)干燥程度
不同谷物存放，有不同的干燥要求，一般稻谷可掌握在籼稻谷脱水至13.5%，晚粳稻谷脱水至14.5%。有自动测定含水率装置的烘干机，初始使用时应校验其读数是否正确，必要时进行修正。测验水分时，不同谷物，旋扭应调至相应谷物位置，使读数不至有误。如用人工水分测定仪测定，应间歇测3～5次，全部达到干燥要求时才可停机。注意干燥后期，随着谷粒含水降低，质量减轻，部分不太饱满的谷粒会被排杂风扇排出。故后期要检查排杂情况，一旦发现有较多谷粒吹出，应适当关小排杂风机的风门。
(6)安全操作
烘干机作业过程中，现场必须有熟悉操作人员，周围应无闲杂人员。作业时不要用手触摸燃烧器，进谷时不要把手伸入料斗内;排除故障时，要待机器停止运转后进行。作业现场严禁烟火，并配有灭火器材。
(7)保养保管
燃烧器要定期清洗，检查提升输送带三角传动带的松紧或有否跑偏，视情况适当调整。作业季节过后，应对机内残留谷粒和杂草彻底清扫;将排风软管和排杂软管拆下放好。外露电线或拆去、或放入机内，防止老鼠咬损电线。然后，把烘干机所有的通道口封闭起来;如较长时间不用，要放松输送带和传动带。