当农民申请补贴的农机具数量超过规定的上限时，他们可以尝试与当地政府或农机具补贴管理部门进行沟通和协商。农民可以向相关部门说明超过上限的原因，例如他们家庭农场的规模较大，需要更多的农机具来进行农业生产。同时，农民还可以提供相关的材料和证明来支持自己的需求，例如土地面积、种植作物种类等信息。通过与政府部门的沟通协商，农民有可能争取到更多的补贴额度。
农民还可以考虑与其他农民进行合作联合申请补贴。如果一个农民的农机具数量超过了规定的上限，他可以与其他农民协商，将一部分农机具纳入其他农民的名下申请补贴。这样不仅可以解决超过上限的问题，还能够促进合作共赢，提高农机具的利用率和效益。
此外，当农民申请补贴的农机具数量超过规定的上限时，他们还可以考虑购买农机具时的时机。有些地区的农机具补贴政策可能会在特定的时间段内开放，农民可以根据政策规定的时间窗口来规划自己的购机时间。如果农民的申请超过了上限，他们可以选择等待下一次补贴政策开放，或者提前购买农机具，等待下一次申请补贴的机会。