选择合适的作业时间是避免秸秆拥堵的关键。通常情况下，秸秆在收割后需要一段时间进行腐熟和分解。在这个过程中，秸秆会自然降解，减少其对农机作业的影响。因此，在深翻作业之前，最好等待足够的时间，确保秸秆已经充分分解，减少拥堵的可能性。
使用适当的农机作业装置也能够有效避免秸秆拥堵。例如，选择合适的翻耙或破碎装置，可以有效地将秸秆切碎，减少拥堵的发生。此外，调整翻耙或破碎装置的高度和角度也非常重要，以确保秸秆能够被均匀地覆盖在土壤中，避免秸秆在作业过程中堆积形成拥堵。
此外，合理的作业速度和作业深度也是避免秸秆拥堵的关键。作业速度过快会导致秸秆无法及时被破碎和覆盖，容易造成拥堵。作业深度过浅则无法将秸秆充分埋藏，同样容易引发拥堵。因此，在作业过程中，要根据实际情况合理调整作业速度和作业深度，确保秸秆能够被有效地处理。
定期清理农机作业装置也是避免秸秆拥堵的重要措施。在作业过程中，秸秆可能会在装置中堆积，导致拥堵。因此，及时清理农机作业装置，确保装置通畅，能够有效地避免秸秆拥堵的发生。