脱粒机本身的设计和调整可能存在问题。脱粒机的设计和调整是为了适应不同作物的脱粒要求。如果脱粒机的设计不合理或者调整不当，会导致籽粒在脱机时不能被有效地清洁。例如，脱粒机的筛子和风机的设置可能不合理，导致籽粒在脱机时不能被完全清洁。
脱粒机的使用和维护可能不当。脱粒机在长时间使用后，易出现部件磨损、杂质堆积和调整松弛等问题。这些问题会影响脱粒机的工作效果，导致脱机时籽粒的清洁度下降。此外，如果脱粒机的清洁工作不及时或不彻底，也会导致籽粒清洁度差的问题。
作物本身的质量问题也可能导致脱粒机在脱机时籽粒清洁度差。例如，作物的湿度过高或者含有大量杂质，都会给脱粒机的工作带来一定的困难，从而影响清洁度。
为了解决脱粒机脱机时籽粒清洁度差的问题，可以采取以下措施：
正确调整和维护脱粒机。对脱粒机的各个部件进行定期检查和维护，确保其正常工作。根据不同作物的要求，调整脱粒机的筛子和风机等参数，以提高脱机时的清洁度。
加强作物的前期处理工作。在脱粒机之前，对作物进行清洗和筛选，去除杂质和受损的籽粒，以减少对脱粒机的负荷和影响。
进行及时的清洁工作。在脱粒机脱机结束后，及时清理残留在脱粒机内的杂质和秸秆，保持脱粒机的干净和正常工作状态。