使用不当也是拖拉机起动困难的原因之一。长期使用拖拉机的人可能会出现忽视电瓶维护的情况，如不定期充电和清理电瓶终端等。这些不正确的使用方法会导致电瓶电能流失，影响电瓶的起动能力。此外，如果拖拉机在低温环境下停放时间较长，电瓶的电能也会因为低温而流失，导致起动困难。
电瓶充电系统故障也是拖拉机起动困难和电瓶跑电的原因之一。电瓶充电系统由发电机、整流器和电瓶等组成，如果发电机或整流器出现故障，将无法为电瓶提供足够的充电电流，从而导致电瓶电能不足。此外，如果电瓶充电线路存在断路或短路，也会导致电瓶无法正常充电，进而导致起动困难。
环境因素也可能导致拖拉机起动困难和电瓶跑电。例如，极端的天气条件，如极寒或酷热，会影响电瓶的工作性能。在极寒的环境下，电瓶的化学反应速度减缓，导致电瓶电能减少，使起动困难。而在酷热的环境下，电瓶内的电解液会蒸发，使电瓶液位降低，进而导致电瓶跑电。