操作人员在使用水田耕整机之前，应该熟悉机器的结构和操作方法。了解机器的工作原理和各个部件的功能，能够更好地操作机器，提高作业效率。同时，操作人员还应该学会正确使用各个控制杆和按钮，熟悉机器的驾驶和操纵技巧。
使用水田耕整机时需要注意安全问题。在操作机器之前，应该检查机器的各个部件是否完好，确保机器的运行安全。在作业中，要注意避免机器与其他物体的碰撞，防止机器翻倒或发生其他意外。同时，操作人员还要注意自身的安全，穿戴防护装备，避免身体接触机器的运动部件。
另外，水田耕整机的作业时机也需要注意。通常情况下，水田耕整机的作业时间应该选择在天气晴朗、土壤湿润的时候。这样能够更好地保护机器的性能，并提高土壤的耕作效果。避免在降雨或土壤过于湿润的情况下使用机器，以免对机器造成损坏或者对土壤造成污染。
水田耕整机在作业中还需要注意减少环境污染。操作人员应该合理使用机器，避免机器在空转或者负荷过大的情况下运行，减少机器的能耗。同时，还要注意减少机器的噪音和尾气排放，保护农田和周边环境的生态环境。