柴油机燃料供给系统最常见的故障是燃料泵故障。燃料泵是将燃料从燃料箱中送到喷油器的关键元件。当燃料泵出现问题时，可能会导致燃料供应不足或者无法供应燃料，从而无法启动柴油机。为了排除这个问题，我们可以先检查燃料泵的滤网是否堵塞，如果堵塞应及时清洗或更换。另外，燃料泵的活塞密封件也可能磨损，这时需要更换密封件。
柴油机燃料供给系统还容易受到水分或杂质的污染。水分的存在会导致燃料气泡生成，从而影响燃料的供给。而杂质的污染则会堵塞燃料滤清器，进而影响燃料的流动。为了解决这些问题，我们应当定期检查燃料箱中是否有水分的存在，如果有，应该及时排除。同时，定期更换燃料滤清器也是非常必要的。
此外，柴油机燃料供给系统还有可能出现喷油器故障。喷油器是将燃料喷入燃烧室的装置，它的工作质量直接影响到柴油机的燃烧效率。当喷油器出现问题时，可能会导致燃料无法正常喷射，从而影响柴油机的工作。为了解决这个问题，我们可以定期进行喷油器的清洗和维护，以确保其正常工作。如果喷油器已经严重磨损或损坏，可能需要更换新的喷油器。