农机报废更新补贴操作程序的第一个环节是报废申请。农机所有者需要向当地农机管理部门递交报废申请，详细说明申请的农机品牌、型号、使用年限等相关信息。同时，还需要提供相关的证明材料，如农机购买发票、使用登记证等。
第二个环节是审核验收。农机管理部门将对报废农机进行审核验收，核实农机的实际使用情况和报废原因，并与申请材料进行对比。同时，还要检查农机的完好程度以及是否符合报废标准。只有通过审核验收的农机，才能享受到更新补贴政策。
第三个环节是补贴发放。一旦农机报废申请通过审核，农机所有者就有资格获得相应的更新补贴。农机管理部门会根据国家相关政策规定的补贴标准，计算出补贴金额。然后，将补贴资金直接打入农机所有者指定的银行账户。
最后一个环节是更新购置。农机所有者可以凭借获得的更新补贴金额，选择新型号的农机进行购置。在购置过程中，农机所有者需要按照相关规定，选择符合国家质量标准的农机，并在购机过后进行备案登记。