外观是最直观的区分方式之一。果蔬烘干机一般采用钢铁材质制作，具有较大的烘干室和通风设备。通常可以看到烘干室内的层架和果蔬的装载区域，以及通风设备的位置。而谷物烘干机则通常采用混凝土或钢铁结构，其烘干室内部通常没有层架，主要是由输送设备和烘干装置组成。由于谷物烘干机需要进行大量的物料输送，因此其外观通常较大，具有输送带和卸料口等特征。
功能上的区别也是鉴定两者的重要依据之一。果蔬烘干机主要用于果蔬的烘干处理，通过控制温度、湿度和通风等参数，将果蔬中的水分蒸发掉，以达到保鲜和延长货架期的目的。而谷物烘干机主要用于谷物的烘干，通过控制温度和湿度，将谷物中的水分蒸发掉，以提高谷物的质量和储存性能。
操作原理也是区分两者的关键。果蔬烘干机通常采用热风循环的方式，通过加热风扇将热空气循环送入烘干室，然后通过通风设备将湿气排出，实现果蔬的烘干。而谷物烘干机则采用热风流动的方式，通过燃烧燃料加热空气，然后通过风机将热风送入烘干室，最后将湿气排出。