联合收割机脱粒不干净可能是由于联合收割机的调整不当所致。脱粒器的间隙过大或过小都会影响脱粒效果。如果间隙过大，庄稼在脱粒过程中容易跳脱，导致脱粒不干净；如果间隙过小，庄稼无法顺利通过，同样也会造成脱粒不完全。因此，正确调整脱粒器的间隙是保证联合收割机正常脱粒的关键。
庄稼的湿度也是影响脱粒效果的重要因素。如果庄稼的湿度过高，颗粒容易粘连在一起，进而影响脱粒的效果。湿度过低，庄稼则容易破碎，同样也会导致脱粒不干净。因此，在进行脱粒作业之前，需要合理控制庄稼的湿度，以确保脱粒效果的良好。
此外，联合收割机的磨损程度也会影响脱粒效果。例如，脱粒器的齿条磨损严重会导致脱粒不彻底，需要及时更换磨损部件以确保脱粒效果。
庄稼的品种和种植时间也可能影响脱粒效果。不同品种的庄稼在脱粒过程中可能表现出不同的特点，需要针对性调整脱粒器的工作参数。种植时间过早或过晚也会影响庄稼的成熟程度，进而影响脱粒效果。