机械故障是导致插秧机分离针碰秧门的常见原因之一。机械故障可能包括零部件损坏、松动或失灵，例如分离针弹簧失效、分离针位置调整不当、分离针与秧门之间的间隙不合适等。这些故障导致分离针无法正常工作，从而碰撞到秧门，破坏了插秧机的正常作业状态。
操作不当也是导致插秧机分离针碰秧门的原因之一。操作不当可能包括对插秧机的错误操作，例如操作员在插秧机工作时未及时停止机器，没有设置正确的插秧参数，或者未按照使用说明进行正确操作。此外，操作员对插秧机的维护不当也可能导致分离针运行不正常，最终碰撞到秧门。
环境因素也可能导致插秧机分离针碰秧门。环境因素包括土壤湿度、土壤硬度、地形起伏等。如果土壤湿度过高，可能会导致分离针与秧门之间的摩擦增加，进而增加碰撞的风险。另外，地形起伏不平也可能导致插秧机不稳定，使分离针与秧门发生碰撞。