国三标准的农机一般都使用柴油作为燃料，而燃烧柴油时会产生一定量的废气。这些废气中含有大量的油水颗粒物，如果直接排放到大气中，会对环境造成污染。油水分离器的作用就是通过分离油水颗粒物，将废气中的油水分离出来，只让净化后的气体排放到大气中。这样可以有效地减少废气对环境的污染，保护大气的纯净度。
另外，油水分离器还能够提高农机的工作效率。柴油中含有少量的水分，如果直接进入农机的燃料系统，会对燃烧过程产生不利影响。水分的存在会降低燃烧燃料的温度，减少燃烧效率，导致农机的动力下降。而油水分离器可以有效地将水分与柴油分离，确保燃料的纯净度，提高燃烧效率，保证农机的正常运行。
此外，油水分离器还能够延长农机的使用寿命。柴油燃料中的杂质和水分会加速农机燃料系统的老化和腐蚀，导致零部件的损坏。而油水分离器能够将杂质和水分分离出来，减少对燃料系统的损害，延长农机的使用寿命，降低维修成本。