当发现柴油机机油进水时，应立即停止使用该机油，并将柴油机停机。进一步的操作将有助于保护柴油机的运转部件，避免进一步损坏。
排放已经被污染的机油。在这个过程中，确保使用适当的收集容器，以防止对环境造成污染。排放机油时，要确保将其存放在合适的地方，最好是让专业的废油处理机构进行处理。
对柴油机进行检查和清洗。在更换机油之前，需要对柴油机进行彻底的检查和清洗。这可以确保所有进水的机油残留物都被清除，并为添加新的机油做好准备。在清洗过程中，可以使用适当的清洗剂和工具，确保将进水的机油完全清除。
加入干净的机油。在进行以上步骤后，可以添加新的、干净的机油。确保使用适当的机油规格和品牌，以保证柴油机的正常运行。在添加机油时，要注意不要超过推荐的油位线，并定期检查机油的质量和油位。