选择合适的泵站位置是安装农用水泵的关键。泵站应该选在离水源较近的位置，以减少输水管道的长度，降低泵站的运行能耗。同时，泵站应该选在相对高地，避免受到污水倒灌和洪水的影响，保证泵站和输水管道的安全。
泵站的基础建设也是一个需要注意的方面。泵站的基础应该扎实牢固，能够承受泵站整体的重量和运行时的振动。基础的混凝土浇筑应该符合规范，通过加强钢筋和控制浇筑质量，确保基础的稳定性。
需要正确安装水泵和相关设备。水泵应该根据泵站的使用需求和水源情况选择合适的型号和规格，确保泵站的出水量和压力满足灌溉的要求。在安装过程中，应该按照水泵的使用说明书进行正确接线和安装，确保电气设备的安全运行。
此外，输水管道的安装也需要注意。输水管道应该选用质量好、耐压性能好的管材，以提高输水效率和减少水力损失。管道的铺设要保持一定的坡度，以便排除管道内的积水和杂质。同时，管道的连接处应该保持严密，防止漏水和压力损失。
安装完成后应进行系统的调试和运行试验。在试运行阶段，需要检查各个部件的工作情况，确保泵站的运行正常。同时，要进行灌溉效果的观察和评估，根据需要调整泵站的运行参数，以提高灌溉效果和节约能源。