如果拖拉机的使用者未能提供有效的购买合同或者其他合法购买凭证，不能办理转移登记。这是因为拖拉机的所有权归属需要有明确的合法依据，只有购买了拖拉机的合法所有者才能享有转移登记的权益。
如果拖拉机存在未清偿的贷款或者抵押，也不能办理转移登记。银行或其他金融机构可能会在购买拖拉机时提供贷款，将拖拉机作为抵押物。在贷款未还清或者抵押未解除的情况下，拖拉机的所有权不属于使用者，因此无法进行转移登记。
此外，如果拖拉机存在相关的法律纠纷，也不能办理转移登记。例如，如果拖拉机被盗或者存在争议的所有权问题，登记机关会暂停转移登记的处理，直到相关法律纠纷得到解决。
如果使用者无法提供拖拉机的相关证件或者登记信息不完整，也不能办理转移登记。登记机关要求使用者提供拖拉机的原始购买发票、机动车登记证书、身份证明等相关证件，以及拖拉机的技术参数、车辆识别代码等信息。如果这些证件或者信息不完整，将无法进行转移登记。